[ImageJ] PENGUKURAN LUAS AREA SEL PADA SAMPEL MIKROSKOPIS

Pengukuran Luas Area Sel pada Sampel Mikroskopis Menggunakan Software ImageJ

Turhadi^1*) dan Yoana Meidita Sri Utami²⁾

¹⁾Program Doktor Biologi Tumbuhan Departemen Biologi FMIPA Institut Pertanian Bogor

²⁾Program Sarjana Departemen Biologi FMIPA Institut Pertanian Bogor

^*)Alamat korespondensi: turhadibiologi@gmail.com

Kalibrasi Skala

• Buka sofware imageJ.

Klik File lalu pilih Open à pilih gambar skala yang sudah didokumentasikan. Pada praktek kali ini digunakan mikrometer objektif (1 skala= 0.01 mm).

• Klik tool garis à pilih straight line. Tarik garis dari ujung hingga ke ujung lainnya pada skala. Maka akan terlihat garis lurus warna kuning. Proses penarikan pastikan benar-benar lurus.

• Klik analyze à pilih set scale. Maka akan muncul laman set scale yang terdiri dari beberapa isian yaitu Distance in pixels, known distance, pixel aspect ratio, dan unit of length. Pada distance in pixels setelah dilakukan proses penarikan garis sebelumnya maka akan muncul angka hasil pengukuran. Pada praktek kali ini muncul angka 1986. Artinya panjang skala yang sedang kita kalibrasi yaitu 1986 pixels.

• Selanjutnya pada isian known distance masukkan angka 1 dan pada unit of length tuliskan mm (bisa menggunakan satuan yang lainnya). Artinya bahwa 1986 pixels sama dengan 1 mm.
• Centang Global agar hasil kalibrasi untuk pengukuran sampel selanjutnya tidak berubah.
•  Klik OK dan proses kalibrasi telah selesai.

Pengukuran Luas

• Tutup gambar skala yang telah dikalibrasi tadi dan sekarang klik File lalu open. Buka file gambar sampel yang akan diukur.

• Jika gambar dirasa terlalu kecil maka sebaiknya diperbesar dengan bantuan tombol positif (+) pada keyboard  atau diperkecil dengan tombol negatif (-). Gunakan tool scrolling tool (simbol sarung tangan) untuk menggeser-geser gambar yang akan dianalisis.

• Setelah gambar dirasa cukup jelas maka selanjutnya klik tool freehand selections (simbol kacang).
• Klik daerah/sel yang akan diukur luasnya dengan cara klik bagian tepi sel, tarik sambil ditahan hingga mencakup sekeliling daerah tersebut dan lepaskan. Maka akan terlihat daerah yang dikelilingi oleh garis kuning.
• Selanjutnya klik Analyze dan pilih Measure (Ctrl+M). Maka hasil pengukuran akan keluar pada output result.

• Kemudian klik Label. Maka akan muncul angka pada daerah yang  diukur sebelumnya. Fungsi penggunaan Label disini yaitu untuk menandai bahwa daerah tersebut sudah dilakukan pengukuran.

• Setelah itu, dapat dilanjutkan dengan mengukur daerah sel yang lainnya seperti tahap sebelumnya. Jangan lupa tekan tool freehand selections (simbol kacang) setiap kali akan mengukur bagian sel lainnya. Setelah proses selesai, selalu klik Analyze à Measure à Analyze à Label.
• Tahapan tersebut dilakukan hingga semua daerah terget selesai diukur.
• Hasil pengukuran luas area dapat dilihat dari output Result.
• Buka Result à klik Edit à Copy à Paste di Ms. Excel.
• Pada program Ms.Excel dapat diketahui luas total dari area target dengan cara menjumlahkan dengan fungsi SUM. Selain itu dari hasil praktek ini, selain dapat diketahui luas area juga dapat diketahui jumlah area yang diamati.

• Selesai.