Sabtu, 29 September 2018

[ImageJ] Threshold Color dan Wand (Tracing) Tool


Pengukuran Luas Area Objek dengan Bantuan Threshold Color dan Wand (Tracing) Tool pada Software ImageJ

Turhadi1*)

1)Program Doktor Biologi Tumbuhan Departemen Biologi FMIPA Institut Pertanian Bogor
*)Alamat korespondensi: turhadibiologi@gmail.com


Terdapat tiga tahap penting dalam pengambilan data luas area objek, misalnya: pengukuran luas daun tanaman. tiga tahap penting tersebut yaitu:
1. Pengambilan gambar pada objek target
2. Kalibrasi skala
3. Pengukuran luas area objek target.



Pengambilan gambar objek target

Proses dokumentasi gambar dapat dilakukan menggunakan bantuan alat, misalnya: kamera digital dan scanner. Pada saat mendokumentasikan gambar jangan lupa skala pembanding diikutkan.



Kalibrasi skala
  • Buka sofware imageJ


  • Klik File lalu pilih open kemudian pilih gambar skala yang sudah didokumentasikan. Pada praktek kali ini digunakan penggaris.

  • Klik tool garis, kemudian pilih straight line.

  • Tarik garis dari ujung hingga ke ujung lainnya pada skala. Maka akan terlihat garis lurus warna kuning. Proses penarikan pastikan benar-benar lurus. 
  • Klik analyze, kemudian pilih set scale. Maka akan muncul laman set scale yang terdiri dari beberapa isian yaitu Distance in pixels, known distance, pixel aspect ratio, unit of length. Pada distance in pixels setelah dilakukan proses penarikan garis sebelumnya maka akan muncul angka hasil pengukuran. Pada praktek kali ini muncul angka 156.05. Artinya panjang skala yang sedang kita kalibrasi yaitu 156.05 pixel.
  • Selanjutnya pada isian known distance masukkan angka 1 dan pada unit of length tuliskan cm (bisa menggunakan satuan yang lainnya). Artinya bahwa 156.05 pixel sama dengan 1 cm.
  • Centang Global agar hasil kalibrasi untuk pengukuran sampel selanjutnya tidak berubah.
  • Klik OK dan proses kalibrasi telah selesai.

Pengukuran luas area objek target
  • Buka file gambar sampel yang akan diukur.
  • Pilih image lalu Adjust kemudian Threshold. Langkah tersebut menghasilkan tampilan berupa background gambar berubah warna menjadi merah.

  • Pada laman Threshold Color, hilangkan tanda centang pada Dark Backgrounds. Langkah tersebut akan menghasilkan tampilan berupa hanya sampel target yang berubah warna menjadi merah.
  • Pilih Wand (tracing) tool.
  • Klik Analyze kemudian Measure. Luas area yang muncul pada laman Results abaikan karena ini bukan hasil pengukuran dari daerah target yang kita inginkan.
  • Klik gambar satu persatu secara bergantian. Setiap kali setelah mengklik gambar target, maka jangan lupa klik Analyze lalu Measure. Hasil dari langkah ini yaitu diperoleh luas area target. Lakukan langkah ini hingga semua sampel/daerah target selesai diukur.
  • Klik Results lalu Summarize pada laman Results hingga diketahui Mean, SD, Min, dan Max dari hasil pengukuran yang telah dilakukan.
  • Selesai.